RNA

Accession Number TCMCG016R23304
RNA Id AWWV01013652.1_mrna_23304
Length 9891bp
Locus_tag CCACVL1_23906
db_xref InterPro:IPR013103
Organism Corchorus capsularis
Molecule_type mRNA
Product Reverse transcriptase, RNA-dependent DNA polymerase
Location join(3364..4471,5798..6001,6192..6508,6613..7114,7288..7591,7995..8094,8536..9108,9338..10531,10639..10963,11214..11469,11578..11794,12219..12361,12485..12967,13309..13760,13950..14129,14211..14506,14656..15003,15196..15433,15721..16244,16457..17223,17413..18325,18485..18636,18742..19036)

Sequence:
ATGGAGGAAGACAGTTCTTCCTCCCATCCAAAAACCCAATCAACAACTTCCCAAACTACCTATGATATCTCTTCACCATATGCTCTTCATGCCTCTGATAATCCAGGCACAACACTAGTAACATGTCTTCTCAAAGAAGAGAACTATCCAACTTGGCGTCGAGCGATGACGAACGCACTTCAAGCGAAAAGCAAATTTGGGTTTGTGGATGGATCTGTTCCACGCCCATCGCTTGGCTCACAAGAAGAATCTTCTTGGGTCAAATGCAACTCCATGGTGATCTCTTGGATTTTCAATGCCCTTCATCCTACTCTTCATGACAGCGTAGCATATTGTGTGACAGCACAAGAGATGTGGAATGACCTTGAAGAACGATTCTCACAAGGTAACGCTGCTCGTATTCATCAACTAAAGACTGAGATGGTGAATACCTTGCAACAAGGCATGTCTGTTTCAGCCTACTACACCAAGTTAAAAGGGATTTGGGATGAACTCGGCACATATTCACATATTCCTCCATGTACTTGTGGATCTGCAAAGGGACTTGCTGCAGAAAGGGAGAAAGAAAAGGTACACCAATTTTTAATGGGCTTAAATGAAAAATATAATGTGGTGCGCTCTCAAATATTGAATACAGATCCATTGCATTCTTTGTCTCGTGCTTATGCGCTTGTCGCACAAGAGGAGCGACAACAACTAGTCGCAGCATCACGCTTACCCTCTGTTGAAGGAGCAGCGTTCATGACCAATAACGCCAACAAAAGCAATTTTAATCGTAAACCTGCAAGCAACCGTGATCTCTCCAAGCTGTTTTGTGAACATTGTAAAAAGACTCGACACACGAAAGACTCTTGTTTTGAATTGCTTGGCTATCCTGAATGGTGGGACAAAGGGAAAAAGCCATCCAAAACCAAGGCAGCCAACACTGCACAGCATATGGAGACTGCTAGTGGTAATAACAATGTACCAATTAATGGGTTGACAAGTGAGCAATATGCCCAACTCATCTCTATGCTTAATCTTGACAAGATTCAGATTCCTACGGCCAACTTTGCGGGTAAGACAACTTCTCTGTCCAATACTGCAATTGAATGGATTTTGGATTCAGCTCCCCATACCACGACCATGATGACCCACACTCCTGAAATCTTAGATTCCAATGACACCACAAATACTAACACACCTCCTACCATACCACAAGAAAATCGACCAGTCCGTGTAAGGAAATTGCCATCCCGTTATCATAACTTTCATGTCGATTTACCAGGAAATAATAAGTCTACTCCCACCTCTTCCAACAATGCTTCCTCAGGGCAGTTACCTACGGGCAAGAAAGCCATTGGATCCAAGTGGGTCTACAAGATAAAGTATCATTCAGATGGAACAATTGAACGATATAAGGCTCGCTTGGTAGCCAAAGGATACACTCAAGTTGAAGTACTTGATTACACTGAAACTTTTGCACCGGTTGCCAAACTTACCACTGTGAGAACATTATTGGCTGTTGTTGCTGCCAAGTCATGGGAATTACACCAGCTTGATGTTCATAACGCATTTTTGCACGGTGACCTTGATGAGGAAGTCTACATGAAACCACCACCTGGCTACCTGTCCTCAAATGACAATCGAGCAGATTCATCTCTTTTTCTACATCACAAGGGCACTTCTTTCACTGCCTTACTTGTGTATGTGGATGATGTTATTATTGCAAGCAACAACAGCTCACACACTAAAGCCCTTAAGGAATATTTGGATGCTTGGTTTCATATTAAAGATCTTGGTCCTCTCAAATATTTCCTTGGATTAGAAGTGGCTCGATCGCCTGAAGGCATAGTCTTATCTCAACGTAAGTACGTCTTGGATATTTTACAAGAGGTGGGTATGCTTGGAACTAAACCTGTTCTCTTTCCCATGGAACAAAATCACAAACTAGCGGTAGATGATAGTGCACTTCTTGATGATCCTGGTGCTTATCGTCGTTTAGTTGGAAGACTGATCTATTTAACCATCACTCGACCAGAGATTTGCTACTCAGTCCATATTCTTTCTCAATTTATGCATCAACCACGACATGGACATTGGGTAGCAGCCCTTCGAGTCTTGCGCTACTTGAAATCTGCCCCTGGTCAAGCCGAATATCGCTCCATGGCTAACACTGCTTGTGAAATTACTTGGCTCCGTACTCTGCTTCATGATTTAACAATTCAACTTCCCATGCCTGCTAACCTTTATTGTGACAATCGTGCTGCCTTAAGTATTGCTGCAAATCCTGTTCATCATGAACGCACGAAACATATAGAAATTGACTGCCACTTCATTCGGGAATGCATCAAATCTGGCTCCATCACTACATCACATGTCTCTTCACACCTTCAACTAGCTGACATCTTCACCAAGGCTCTCGGACATACTCAATTTCAATTTCTTACTAGCAAATTTTCAGAGGAAAAGATGGAGGGTAATCTGGGTTTCCTTGGTACTACATTTTCATGGTCTCTTGAAGACATTTTCAATGAAAATCTCTACAAGAATCAGGTGGAAAGGATTCCATATTCATTTCAGTCCATTAAATCATATTTTGGGTCATATGTTTTACCTTTATTGGAAGAGACACGAGCAGCAATGTGTTCATCTTTAGAAATTATAAGCAGAGCGCCTTATGCTGAAGTGACAAATCTTGAGGCATCAAAGTACACCTATGGCATACATATCAATTGCTGGAGAAACAGGTTGAGTGATGATGGAAAGGTACCATACAGAATACAGCCTGGAGATATTCTACTTTTAGCAGATGAAAAACCAGAAACTGTTTCTGATTTAGAAAGGGTAGGAAGAACATGGACTTTTGCCTTGGTTACGAATATCTCAGATTTTAGGATTAAGGATGTAAATGAGGATAAAATTGAGGATGAAGATGAGAATAGTAGCACATCTACTTGTTTCATAGTGAAGCCTCAGAAAGACATTGCATCTGAAGAAGGGTTGTTGCAGAAATCACTCTATGTAGTTTTCTTGATGAACTTAACCACCAACAGGCGAATATGGAGTGCATTGCACATGTACGGAAACCTAAGTATTATTAAGGAAGTTTTGTGCCCTGGTTCTCAGGTTGAAGAAAGCTGTCCTCTCTGTTCCATACAGAATAGGGGAACCTCAGATGAGAATTTTCTGACAAGTTTGCTGTCTCAACTGAATGAATCTCAAAAGGATGCAGTTTTGGCTTGTCTAAACAAAATACAGTGCAACTACAAGTCTCATTTGGAACTGATTTGGGGCCCTCCAGGAACTGGAAAAACTAAAACAGTTAGTGTGCTGCTGTTTTCTTTGTTGAGAATGAAACATCGCACACTTACTTGTGCTCCCACAAATGCTGCAATCAGAGAAGTTGCTGCAAGAGTTGTAAAGCTGTTGAAAGAATCTAATGAAACAGATTTTTCTTTTTATTCCTTGGGAGACATCCTCTTGTTTGGCAATAAGGAGAGACTTGAAGTTGGCTCCGAGATCGAAGAAATATTTCTGGATTATCGTGTAGAAAGGCTTACAGACTGCTTAGGGCCGCTGGGTTGGCTTTACTGGTTTAACTCAATGATTAGTTTTCTTGATGATTGTGTGTCTGACTACCATATTTTCTTGGAAAACGAATTAACCAAAGAGAGGGAGCAAAGCACTGAAAATGCAAACCGAGAGAAAGGGTGTTGCAGTGACATGTCATTTCTTGAATATGCAAGAGAAAGATTTACCTCTATAGCATCATCATTGAGAAAATGTGTCTCAACTTTATACACTCATATACCAAAAGTCTACTTTCTGGAACATAATGTCCAAGAGATCAAAACCCTTTTTGGTTTGCTTGATTCTTTTGAAACTCGTCTTTTTTTTGATGAAATAGTTTCTGAAGATGTGGAGGAGCTTTTTTCCAACTCAAGAGATGGTGATGTTCTGTCCAAGAACATCAATGAGGCACCATGCATGTTGACATTGTGCTCGCTGAGAAGCCAGTGTCTTTCTGTTTTAAAAACCCTCCGTGCTTCCCTTAGTAAACTTAAACTACCAAGAGCCAATTATAATGATTCCAATTCCATAGTGCAATTCTGTTTCCAAGCAGCAGATCTACTCTTTTGTACTGCAGCTAGTTCATATAGACTCCACAGAGTGGCAATGGAACCACTCCAGGTGCTGGTAATTGATGAGGCAGCACAGTTGAAAGAGTGCGAATCAGCCATACCATTGCAACTCCCAGGTCTAGTACATTCCATTCTCATCGGTGATGAGTGCCAATTGCCTGCTACTGTTCAAAGCAATGTATCTGGTGAAGCCAGCTTTGGAAGAAGTTTATTTGAAAGGTTGAGTTTGTTGGATCATTCAAAGCACCTTCTGAATGTTCAGTACCGAATGCATCCATCGATCAGTTTCTTCCCAAATGCAACGTTCTACAATAACCGTATCTTGGATGCACCGCATGTTAAGCATGAAAGTTATGAGAAACATTATCTCCCATGGCCTATGTTTGGTCCCTATTCCTTTATTAATGTCCCTGGAAGAGATGTAGTTGATGATGTTGGACACAGCCGTAAAAATATGATTGAGGTAGCTGTTCTCCATCGATTGTTGCGAACTCTTTACAAAGCATGGAATGGCTCAAAAGAGAAGCTCAGTATAGGTATCATATCTCCCTATGCTGCTCAGGTTGTTGCAATTCGGAACAAACTTGGTAGCAAGTATGAGAAGCTTGATGGCTTTACCGTGAAGGTGAAGTCAGTCGATGGGTTCCAAGGTGGTGAGGAAGACATAATTATAATATCAACTGTGAGATCAAACACTGCAGGAGCAATTGGGTTCGTATCCAATCGTCAAAGAACTAATGTCGCTCTTACAAGGGCAAGGCACAGCCTATGGATTTTGGGGAATGGAAGAACGCTGGCTAACAGTGAATCCGTCTGGGAGGATTTAATTCGTGATGCAAAGGAGCGCCATTGCTTCTTTAATGCTGAAGATGACAA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